Tujuan dari Yayasan Pendidikan Islam Al Fikri adalah untuk menjadikan generasi muda bangsa untuk menjadi cendekiawan muslim yang takwa, berakhlak mulia, beramal shaleh, sehat jasmani-rohani, cerdas, terampil, percaya diri dan bertanggung jawab, serta diharapkan dapat menjadi pemimpin bangsa dan umat.